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病原体靶向测序:感染性疾病筛查的新利器

2024. 05. 21

在当今医学诊断领域,病原体检测一直是关注的焦点。随着科技的不断发展,病原体靶向测序(targeted Next Generation Sequencing, tNGS)技术的出现为临床诊断带来了全新的可能性。本文将探讨病原体靶向测序的原理、优势以及应用前景,并结合迪赢生物的产品方案,为您呈现这一前沿技术的魅力。

 

什么是病原体靶向测序?

病原体靶向测序是一种将多重PCR技术与二代测序技术相结合的先进技术。通过设计特定的引物,可以在样本中富集目标序列,然后进行高通量测序,快速、高效地检测出样本中存在的各类病原微生物。相较于传统的检测方法,病原体靶向测序具有更高的灵敏度和特异性,同时能够实现对多种病原体的同时检测,为临床诊断提供了全面的信息支持。

 

tNGS技术的优势

tNGS技术具有多方面的优势,其中包括:

高效快速:通过针对性的引物设计,可以快速、准确地检测出样本中存在的各类病原微生物,缩短了诊断时间,为临床治疗提供了及时的依据。

多样性检测:不受特定病原体类型的限制,可以广泛应用于各种临床样本的检测,包括细菌、病毒、真菌、寄生虫等各类病原微生物。

低成本高效益:通过有针对性的引物富集目标序列,避免了对整个基因组的测序,降低了测序成本,提高了检测效率。

 

迪赢生物的病原体靶向检测解决方案——PathoSeq 450病原库

●广谱且全面的检测

迪赢生物结合专家共识推荐的检测内容,及临床中常见的病原检出情况,推出病原库,包含病毒、病毒、细菌、真菌、寄生虫等400种病原微生物;同时还提供毒力和耐药基因位点检测,实现一次检测致病菌和耐药基因。

●高特异性

迪赢PathoSeq 450病原库针对每种病原序列设计特异性引物,可以有效去除宿主核酸的干扰,提升检测的灵敏度和特异性;DNA&RNA共检流程,也极大地缩减了人力和时间。

●灵活搭配,需求定制

PathoSeq 450病原库,单个病原,单管引物;客户可以根据需求进行病原种类的搭配,可满足几十种到几百种病原的检测需求,同时也极大的缩短了引物设计及优化时间,即取即用型,高效省时。

 

病原体靶向测序在感染性疾病筛查中的应用

1. 传染病的快速诊断

病原体靶向测序技术能够在短时间内提供高精度的病原体鉴定结果。这种技术通过捕获和测序特定的病原体基因片段,可以快速确定感染的具体病原体类型。相比传统的培养和生化检测方法,靶向测序具有以下优势:

速度快:从样本采集到结果分析,靶向测序大大缩短了诊断时间。

高灵敏度和特异性:能够检测到低丰度的病原体,并准确区分不同病原体之间的微小差异。

广谱检测:一次测序可以同时检测多种病原体,特别适用于症状不明确或多重感染的病例。

具体应用案例:

呼吸道感染:对于不明原因的肺炎或呼吸道感染,靶向测序可以快速鉴定病原体,如流感病毒、冠状病毒(如SARS-CoV-2)、细菌性病原体(如肺炎链球菌)等,指导临床治疗。

血流感染:在败血症或菌血症的诊断中,靶向测序可以快速识别血液中的病原体,避免传统培养方法的低检出率问题。

2. 抗菌素耐药性监测

抗菌素耐药性是当前全球公共卫生面临的重大挑战。通过病原体靶向测序,可以检测病原体基因组中的耐药基因,评估其对抗生素的耐药性。这一信息对于指导临床用药和制定抗菌策略至关重要。

应用实例:

医院感染控制:在医院内发生感染暴发时,通过靶向测序检测耐药基因,可以迅速确定耐药性病原体的种类和传播途径,帮助医院采取针对性的控制措施。

抗菌药物选择:对于重症感染患者,通过耐药性基因检测,选择最有效的抗菌药物,避免盲目用药和多药联合治疗带来的副作用。

3. 多重感染检测

多重感染是指同一患者同时被多种病原体感染的情况。传统的检测方法往往只能识别单一病原体,而忽略了其他潜在的感染源。靶向测序技术通过对样本中所有病原体的基因组进行捕获和分析,能够全面检测多重感染情况,提供更准确的诊断信息。

应用场景:

免疫功能低下患者:如艾滋病患者或接受免疫抑制治疗的患者,靶向测序可以识别多种共感染病原体,指导综合治疗方案。

复杂感染病例:对于临床表现复杂、多次治疗无效的感染病例,靶向测序有助于发现潜在的多重感染病原体,为诊断和治疗提供依据。

 

结语

病原体靶向测序技术为医学诊断带来了全新的视野和可能性。迪赢生物作为这一领域的领先者,将持续不断地致力于技术的创新和产品的优化,为医学诊断提供更加精准、高效的解决方案。

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