应用场景
簇式喷墨法高通量DNA独立合成用于基因合成
使用柱式合成法进行基因合成时,每条序列独立合成完成后需要混合成寡核苷酸池再进行后续的基因组装,需要复杂的手工混合寡核苷酸池过程,并且每条序列合成的产量一般为nmol量级,远大于组装时的需求量,造成原料浪费进而提高合成成本。
而基于芯片的高通量合成,虽然合成单条序列成本低,但单个寡核苷酸合成的产量一般为fmol量级,后续基因组装前需要先进行多次PCR扩增。当一张芯片上合成的全部核酸序列需要切割下来成为一种混合物时,为了避免混合物中多种序列间的相互作用,每种核酸的序列和合成的量需要精心设计,而且在基因合成时,需要将寡核苷酸混合物用通用引物等方法将混合物拆分出若干个寡核苷酸亚池,再进行后续的基因组装,过程操作复杂。
簇式喷墨法高通量DNA合成产量适中,能够达到无需进行PCR扩增同时不造成浪费,非常适用于基因合成。结合迪赢自主研发的自动化基因合成装置,可实现简单低成本、高通量自动化的基因合成。
图2.高通量基因合成流程图
簇式喷墨法高通量DNA独立合成用于DNA杂交捕获探针合成
DNA杂交捕获探针根据覆盖区域大小不同,需要几千到几十万不等的寡核苷酸探针,同时要求每条探针量达到pmol级。
传统柱式合成方法合成产量过高,且通量受限,目前最大通量可实现768条寡核苷酸并行合成。提升合成通量的解决方案通常是直接增加设备和劳动力数量,但从长远来看,这种解决方案不利于节能减排和降低成本。
使用芯片合成可以满足通量需求,但单条寡核苷酸探针产量过低。
相比之下使用迪赢簇式喷墨法高通量DNA独立合成平台能够很好满足通量和产量的需求,实现最高性价比。
平台合成数据展示
以下为簇式喷墨法高通量合成平台合成寡核苷酸独立回收后进行凝胶电泳及质谱检测的部分结果展示。
图3.凝胶电泳图(数字代表随机抽取的编号)
图4.质谱图
迪赢持续研发新一代核酸合成
迪赢生物专注新一代核酸合成,除簇式喷墨法高通量DNA独立合成技术,同时还拥有超高通量芯片法寡核苷酸合成技术。未来迪赢也将持续研发,期望通过技术突破实现更高质量、更长长度以及更低成本的核酸合成,助力相关领域的发展。
【参考文献】
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