寡核苷酸池(Oligo pools)是成千上万条不同序列的寡核苷酸集合,可应用于CRISPR sgRNA文库、突变体库、抗体库、高通量报告基因分析(MPRA)、靶向测序、荧光原位杂交(FISH)、高通量基因合成、DNA储存等。
高通量DNA合成平台
我们的寡核苷酸池是由迪赢开发的高通量DNA合成平台合成的。该平台可以在一个芯片上合成长达230nt、多达150万条寡核苷酸,并且具有很高的准确性和均一性。
主要优势
-
高通量
单个芯片上可同时合成多达150万条不同的定制化序列,长度可达230nt
-
高质量
大于99%的覆盖度和高均一性,合成错误率低至千分之一,每条oligo为0.1-1 fmol
-
工作流程

应用领域

● CRISPR sgRNA 文库
sgRNA文库由数以千计的质粒组成,包含了每个目标基因的多个sgRNA。这些文库利用CRISPR基因编辑技术的高效性和特异性来敲除基因表达或转录激活基因,是对重要分子靶点进行高通量筛选的理想选择。

● 突变体库
一次合成数千种以上的突变体,以确定结构和功能性的关键位点。突变体库广泛应用于蛋白质工程、代谢工程和抗体优化领域。

● 抗体库
合成抗体库是由经过设计的合成DNA片段构建的。这些抗体库能够产生针对不同蛋白抗原的特异性抗体,简化了在自然免疫中产生特异性抗体的过程,是加速抗体发现进程的有力工具。

● 高通量报告基因分析(MPRA)
高通量报告基因分析(MPRA)可以利用高通量测序和barcode技术同时对成千上万的调控元件进行功能验证,能够帮助研究人员阐明遗传变异的功能,并确定与人类疾病和性状相关的遗传变异。

● 靶向测序
通过高通量合成平台合成特定的探针,可以有效地富集目标区域,从而降低测序成本。

● 荧光原位杂交(FISH)
Oligo pools有助于FISH探针的快速开发,和其它空间转录组的研究应用,如MerFish,可在单个细胞内做空间定位的基因表达谱鉴定分析。

● 高通量基因合成
近年快速发展的合成生物学需要更高通量的基因合成,传统基因合成已无法满足要求。而高通量Oligo合成使合成大量基因成为可能,更能满足合成生物学日益增长的通量需求。

● DNA储存
DNA序列作为数据存储的介质,具有高密度、稳定和耐久的特性,是目前具有极大潜力的信息存储问题解决方案。
发表文献
● Zhang H, Deng S, Ren L, Zheng P, Hu X, Jin T, Tan X. Profiling CD8+ T cell epitopes of COVID-19 convalescents reveals reduced cellular immune responses to SARS-CoV-2 variants. Cell Rep. 2021 Sep 14;36(11).