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应用

MSI

近年来,随着诊疗水平的进步和靶向药物、免疫治疗的出现,免疫检查点抑制剂应用得越来越广泛。微卫星不稳定(Microsatellite Instability,MSI)是一种预测患者对免疫检查点抑制剂响应的重要生物标志物,同时也是一个泛癌种生物标志物,它在肿瘤的诊断和治疗中扮演着重要角色。

 

什么是MSI?

微卫星不稳定(Microsatellite Instability,MSI),是指由于在DNA复制时发生插入或缺失突变引起的微卫星(Microsatellite, MS)序列长度改变的现象,常由错配修复功能(Mismatch repair, MMR)缺陷引起。MS序列,是一些短而重复的DNA序列,一般由1~6个核苷酸组成,串联重复排列,常见类型为双碱基CA/GA/GT或单碱基A/T等。

 

MSI的检测方法

比较内容 MMR-IHC MSI-PCR-CE MSI-NGS
检测内容 ·MMR蛋白表达(MLH-1、MSH-2、MSH-6、PMS-2)

·单碱基/两碱基 微卫星序列长度变化

·卫星位点重复序列长度变化,不同Panel微卫星位点数不同
结果判断 ·4个MMR蛋白任意一个表达缺少为dMMR ·≥2位点不稳定为MSI-H(检测5-6个位点) ·根据不同位点和分析方法制定阈值
优点

·方法成熟,临床普及度高

·价格低

·可直接提示MMR蛋白缺少

·金标准

·准确简单快速

·敏感性高、特异性强

·易标准化、自动化

·多应用于中大型Panel的伴随检测,综合成本较低

·结合生信算法优化的数据分析可以更好的提高低突变丰度样本的检出。

缺点

·需要规范的组织前处理

·组织异质性

·存在假阴性及假阳性

·对病理医师要求高,主观因素可能导致结果偏倚

·价格中等

·技术复杂,不易标准化

·缺乏行业统一标准和广泛验证,可能因算法不同输出结果不一致

·价格高

·无有证试剂

临床应用 ·为目前我国临床MSI/MMR检测的基本推荐 ·MSI检测公认金标准,推荐在具备分子诊断设施的实验室开展

·单独检测MSI相对时间周期略长

·市面上探针设计及生信算法水平参差不齐,筛选及验证成本较高

 

MSI的临床意义

Lynch综合征的筛查

Lynch综合征,亦称遗传性非息肉病性结直肠癌(HNPCC),是一种呈家族遗传倾向的常染色体显性的遗传性肿瘤,由MMR基因发生胚系突变所致。Lynch综合征约占所有结直肠癌(Colorectal carcinoma, CRC)患者的3%~5%,且绝大部分Lynch综合征患者都呈现出MSI-H的表型。因此可以使用MSI作为Lynch综合征的普筛手段。

 

MSI是Ⅱ期结直肠癌预后因子

目前,临床上推荐对高危Ⅱ期CRC患者进行术后辅助化疗,对具有dMMR/MSI-H表型的CRC患者来说,虽然往往组织学分化较差,但通常预后较好,故dMMR/MSI的检查可以判断组织学分化差的高危II期CRC患者的辅助化疗效果。

 

MSI是Ⅱ期结直肠癌辅助化疗疗效预测因子

一项meta分析显示,具有dMMR/MSI-H表型的Ⅱ/Ⅲ期CRC患者不能从5-FU单药辅助化疗获益,且Ⅱ期dMMR/MSI-H患者接受5-FU单药辅助化疗生存期反而缩短(HR=2.95;95%CI:1.02~8.54)。数据表明,对于具有dMMR/MSI-H表型的Ⅱ期CRC患者,给予5-FU单药辅助化疗非但不能生存获益,反而对长期生存产生不利影响。

 

MSI是晚期实体瘤免疫治疗疗效预测因子

MSI-H表型的晚期实体瘤患者接受免疫检查点抑制剂[如抗程序性死亡受体-1(programmed cell death-1, PD-1)/程序性死亡受体-配体1(programmed cell death-ligand 1, PD-L1)抗体]治疗往往具有显著疗效。因此,MSI作为晚期/转移性实体瘤患者特别是CRC患者的免疫治疗疗效预测生物标志物,其检测可以为临床治疗提供重要指导。

 

 

我们MSI检测产品

迪赢自主研发的泛实体瘤相关的746个基因产品,适用样本类型包括cfDNA、组织样本以及FFPE,具有高灵敏度,适合应用于NGS肿瘤液体活检之中。覆盖多种药物选择,包含FDA和NMPA批准上市的抗肿瘤靶向药物,免疫治疗药物以及部分在研药物的靶点基因。检测范围包括了编码区、内含子区及启动子区等区域,提供全面的肿瘤图谱,完整评估免疫治疗相关的MSI和TMB异常。

 

产品名 货号 样本需求 靶标大小 独有的 双链RNA 探针捕获 优点
QuarXeq Pan-Cancer Ultra Panel NY1015 10ng-200ng.可适用于FFPE样本 5.9Mb 高覆盖率及完整保留文库信息 全面的肿瘤图谱以及MSI和TMB完整评估

 

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