正常细胞发生DNA双链断裂时可以通过同源重组修复(HRR,Homologous Recombination Repair)来维持基因组稳定,HRR相关基因的突变会引起同源重组修复缺陷(HRD,Homologous Recombination Deficiency)的发生,表现为“基因组瘢痕”(Genomic Scar,GS)。通过对HRD的检测,可以对癌症进行风险评估,包括乳腺癌、卵巢癌、胰腺癌等;同时,因为大多数HRD肿瘤表现为对PARP抑制剂(PARPi)以及铂类药物高度敏感,则可以通过对HRD的检测结果进行疗效预测,在临床上指导用药。
“暗探针”技术,让差异化捕获显而易现
全面的HRD评估包含HRR相关基因的变异检测和基于SNPs位点的基因组瘢痕鉴定。从临床检测的准确性出发,HRR基因检测和基于SNPs位点的基因组瘢痕鉴定一般分别要求不小于500x和100x有效测序深度,来检测频率不低于1%的突变和中国健康人群中高 MAF 值的 SNPs位点。对于差异化捕获的需求,迪赢自主研发的“暗探针”技术,优化了传统控制探针比例的策略带来的结果不稳定性,巧妙地在捕获环节线性化实现差异捕获。
基因列表
ATM
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BRCA1
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BRCA2
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BRIP1
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BARD1
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CDK12
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CHEK1
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CHEK2
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FANCL
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PALB2
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PPP2R2A
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RAD51B
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RAD51C
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RAD51D
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RAD54L
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TP53
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PIK3CA
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ERBB2
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FOXA1
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ESR1
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产品特点
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检测更全面
QuarXeq HRD Probes 依据NCCN指南及临床试验经验精选20个与DNA同源重组修复相关的核心基因;同时筛选出5万个高 MAF 值的 SNPs 位点,尽可能覆盖更多的杂合位点,用于基因组瘢痕鉴定。
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定制优化周期更短
对于差异化捕获的需求,“暗探针”技术显著缩短优化周期,可以依据客户不同的差异化捕获需求轻松实现等比缩放。
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稳定性更高
“暗探针”技术优化了传统控制探针比例的策略带来的结果不稳定性,具有较高的批内重复性和批间重现性。
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性价比更高
差异化捕获直接带来了测序成本大幅下降。
“暗探针”作用示意图