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百万探针,极速交付,迪赢生物助力探针捕获法tNGS病原检测

2023. 08. 16

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病原微生物是指可以侵犯人体,引起感染甚至传染病的微生物,或称病原体。常见的病原检测技术包括菌液培养、血清免疫学检测、分子生物学检测和高通量测序。2020年新冠疫情肆虐全球,NGS检测方法在新冠病毒的基因组序列解析过程中发挥了重大作用,同时也极大推动了NGS在病原检测应用的快速进展。根据检测技术路线不同,用于病原检测的NGS包括宏基因组二代测序(mNGS)以及靶向测序(tNGS)。

 

宏基因组二代测序(mNGS)检测

 

宏基因组二代测序(Metagenomics Next Generation Sequencing,mNGS)是借助二代测序平台,提取感染样本的核酸进行高通量测序,可以无偏倚的检测到样本中的所有病原体。

 

 

mNGS检测技术较其他检测来说,具有无偏倚性,广覆盖、高准确性等优点,同时也可以发现新发性的感染。但是因为样本中人源占比太高,会影响病原检出,报告解读难和检测费用高也是mNGS在临床应用中的难题。

 

靶向测序(tNGS)检测

 

根据靶向富集方法的不同,tNGS检测方法包括超多重PCR和液相探针捕获两种技术路线。

 

基于多重PCR富集的靶向测序tNGS

 

基于超多重PCR的靶向测序技术,是将PCR技术与二代测序技术相结合,通过设计的病原多重引物正向富集目标序列,进行二代测序检测。与mNGS检测方法相比,通过多重PCR靶向富集病原,具有准确性高、性价比高等特点。聚焦目标病原也使得报告解读变得简单。

 

640多重PCR富集靶向测序流程图

 

基于探针捕获的靶向测序tNGS

 

液相探针杂交捕获技术是根据核酸分子碱基互补杂交原理,设计分子探针。探针带有生物素修饰,当探针与目标区域杂交结合后,通过链霉亲和素磁珠将探针吸附,从而将目标区域捕获。设计的捕获探针不存在干扰问题,因此不会限制目标病原的种类。

 

 

该技术很好地解决了mNGS和基于多重PCR的tNGS技术的问题;使用探针捕获,病原靶标没有限制,达到广覆盖;靶向富集病原序列,可以去除人源干扰,实现高灵敏度。目前市场上多家企业已发布了基于探针捕获的病原检测产品。

 

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探针捕获靶向测序流程图

 

百万探针,极速交付

 

探针是实现液相杂交捕获技术检测病原的核心,要实现病原种类的广覆盖意味着需要合成大量探针,甚至上百万条。传统的核酸合成采用柱式单条独立合成,通量受限导致合成周期较长,同时单条合成成本较高也会导致检测成本的增加。

 

迪赢生物基于自主研发的高通量合成平台,单张芯片上可合成多至150万条、长至230nt的寡核苷酸序列,百万条探针可实现一周极速交付,助力感染性病原精准诊疗。

 

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· 一周极致交付

· 低成本

· 单次合成通量150万条

 

迪赢平台合成探针捕获法panel检测效果。以肺炎克雷伯菌为例验证探针捕获富集效果,结果显示靶向捕获方法中目标序列丰度是mNGS检测约23倍。

 

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全面助力病原微生物精准检测

 

mNGS,超多重PCR法tNGS,探针捕获法tNGS三种技术路线各有优势,互为补充,适合病原检测不同的应用场景和检测需求。除提供探针定制, 迪赢生物也可提供超多重检测及mNGS检测相关工具,全面助力病原微生物精准检测。

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