新品上市！迪赢推出高通量芯片法MRD探针

MRD，作为一个新Biomaker，给肿瘤的诊疗带来了新的视角，高质量、标准化的MRD临床数据在接受MRD阴性作为早期临床试验终点发挥了重要作用。MRD检测意义不仅是在于检测出需要治疗的患者，也在于通过MRD检测寻找出不需要治疗的患者。但是由于高昂的检测成本和技术资源限制，导致基于NGS方法的MRD检测方法在临床应用渗透率还不足。美国作为全球MRD检测市场的领导者，其中Natera公司是美国 MRD检测领域的绝对龙头企业。其核心产品Signatera是一款个性化肿瘤 MRD检测产品，基于NGS技术，通过分析血液中游离肿瘤DNA片段实现癌症复发风险监测。2024年第四季度，Natera的MRD检测量达到14.5 万例，同比增长62.9%，其肿瘤检测样品中MRD占比已达到 96%。

 

目前国内的MRD检测与发达国家相比还有很大的差距，市场增长潜力巨大。检测成本较高等问题限制了MRD检测在临床端的普及。主流的MRD检测技术是基于Tumor-informed技术路线，因为需要为每一个病人单独定制一套探针，还需WES的先验结果，定制探针合成都是主要的成本所在。

 

上海迪赢生物，作为国内领先的高通量DNA合成和NGS探针供应商，一直专注于高通量DNA合成这一底层技术的开发，始终站在用技术创新为IVD企业提供更高质量更低成本原料的角度，期望每一项好的技术都能为开发患者可以负担的好产品助力！迪赢生物最新推出高通量芯片法MRD定制探针合成，结合WES4.0肿瘤版（详见迪赢生物-新品上市 | QuarStar人全外显子组肿瘤版），为下游MRD检测提供整套解决方案。

 

迪赢高通量芯片法MRD定制探针

 

01.超高密度探针设计

不管是酶切或超声打断的基因组片段，还是细胞凋亡游离于外周血中的cfDNA片段，每个基因组拷贝的断裂点大概率均不相同，常规1xTiling探针设计，在基因组拷贝数投入量充足的情况下基本可以满足检测需求，但是对于极低丰度的cfDNA MRD检测，迪赢推荐更高Tiling（10x）叠瓦式探针设计，确保低拷贝的不同阳性断裂片段均能被高效捕获到，避免了位于cfDNA边缘的突变位点杂交结合不完全导致的漏检，更高Tilling密度探针可以提高检出灵敏度。

 

02.超高冗余合成

传统柱式探针，每条序列均在单个CpG柱中完成合成，存在单孔合成失败或者漏合现象，导致因为探针遗漏而影响后续NGS捕获覆盖度的问题。另外不同探针必须人工定量和混合，这个过程也导致了不同探针浓度差异，进一步影响后续的捕获均一性。

迪赢高通量DNA探针合成平台，单条探针序列被随机重复排布到不同合成位点上，至少被冗余合成100次以上，将单条探针合成遗漏的概率降低至几乎为零，确保了稳定的交付周期。同时单条序列的多遍重复合成，大大提高探针的浓度一致性，使得的后续NGS捕获更均一。

 

03.超高生物素标记效率dsDNA探针带来卓越性能表现

传统柱式合成探针产物中，会存在大量非全长副产物（没有biotin修饰），影响探针的捕获效果和有效深度。

 

迪赢高通量dsDNA探针采用专用的标记技术，使得生物素修饰效率高达95%，特别是在MRD小panel的捕获上，拥有更优异的捕获性能（中靶率、均一性和有效测序深度）。

 

- 更高的Biotin修饰效率

 

- 更高的捕获效率

 

- 更高的均一性和有效测序深度

 

04.更灵活的组合方案

基于迪赢高通量合成平台优势，在提高合成通量的同时，也极大的降低了原料的浪费。此外，迪赢建议客户将固定化核心panel和定制化panel合并一起合成（支持单个panel最高300条探针在一个价格区间，客户端探针成本低至3元/条），大大降低合成成本的同时，也减少了每次实验探针混合的批间差异和出错风险。

 

05.更极致成本DIY模式

在标准化高通量芯片法MRD探针定制合成基础上，结合迪赢高通量DNA合成的超高产能，也给客户提供了另外一种基于mini oligo pool的超低成本/超高通量的MRD探针合成解决方案。

我们支持客户使用我们的oligo pool原料和NGS探针专用的高效生物素标记试剂盒打包方案进行自主探针生产。满足更加多样化的设计和更加个性化的需求。进一步降低企业的原料成本。单张芯片上批量合成96个MRD探针，可在短至3天内交付96个独立oligo pool，如果客户在每个oligo pool内使用index进一步拆分不同Panel，还可以进一步降低成本。可以实现单次合成满足96、384、1536等病人的MRD探针需求。