• 最新、覆盖最全面的人类甲基化组学超大 Panel

迪赢生物QuarStar Human MethylCap Panel（NX5001）系统覆盖CpG岛、CpG岛岸（shores）、CpG岛架（shelves）、启动子区域（±2 kb）、增强子区域（Enhancers）、差异甲基化区域（DMRs）、表观遗传关联位点（EWAS）、非编码RNA区域（lncRNA/miRNA）、疾病相关GWAS区域以及高保守性区域（高phyloP得分）等，上述位点均基于最新数据库注释信息筛选而来（表1）。

 

 

表1.人类甲基化组学研究超大Panel参考数据库

 

QuarStar Human MethylCap Panel覆盖了多款国内外主流甲基化大Panel和甲基化芯片产品的位点（图1-1，96.65-99.42%），并在此基础上新增近百万个高价值CpG位点，使其在覆盖范围与注释完整性方面处于行业领先水平（图1-2，图1-3）。

 

图1. QuarStar Human MethylCap Panel更全面的覆盖度

 

 

图1-1. QuarStar Human MethylCap Panel与主流甲基化芯片产品及甲基化大 Panel （VendorA、VendorB、VendorC、VendorD）覆盖重叠区域。

图1-2. QuarStar Human MethylCap Panel中CpG位点在各染色体的分布情况。

图1-3. QuarStar Human MethylCap Panel中CpG位点的区域分布情况（以碱基对计）。

 

 

• 简并碱基探针设计，降低成本、提升覆盖效率

迪赢生物在传统“四链法”探针设计基础上，引入独特的简并碱基（N/R/S/Y）合成策略，可以在同一个合成位点实现多条组合探针的合成，大幅降低了合成成本（图1）。

 

图2.甲基化探针设计原则：对于A、T、G位点直接取反向互补序列；对于非CpG位点的C，在探针上设计为A；CpG位点的C可能处于甲基化或非甲基化状态，在探针上设计为R（A/G）。

 

• 甲基化专用封闭试剂 QuarHyb DNA Methyl Enhancer

针对甲基化文库序列复杂低、GC含量下降的特点，迪赢生物开发了甲基化捕获增强剂——QuarHyb DNA Methyl Enhancer（NF5010）。该试剂在不影响Coverage和 Uniformity等关键指标的前提下，可提升封闭效果，显著降低脱靶率（图3）。

 

• 卓越的捕获和检出性能

QuarStar Human MethylCap Panel具有优异的基本性能：TargetRatio 93.20%，Coverage 99.02%，Uniformity 98.47%（图4-1），并保持良好的重复性（皮尔逊相关系数为0.99，图4-2）。与WGBS进行一致性分析，甲基化水平呈现高度一致（图5，R=0.98），为学术研究及临床探索性研究提供了可靠选择。

 

图4. 优秀的基本性能，良好的实验重复性

 

图4-1. NA24385建库，使用QuarStar Human MethylCap Panel及迪赢甲基化专用杂交捕获试剂进行捕获。

图4-2. 100ng NA24385从建库至捕获进行两次重复实验，测序数据进行一致性分析。

 

图5. 与WGBS甲基化水平高度一致。 100 ng NA24385 DNA建库，分别进行WGBS和迪赢生物QuarStar Human MethylCap Panel捕获，选择交集的CpG位点进行一致性分析。